Bio-informaticus in Groningen

Medische Biologie en Pathologie, sectie Medische Biologie

Experimental Pulmonology and Inflammation Research (EXPIRE) is één van de onderzoeksgroepen van de sectie Medische Biologie van de afdeling Pathologie & Medische Biologie. Het EXPIRE lab richt zich op translationeel onderzoek aan chronische inflammatoire aandoeningen van de longen, zoals astma en COPD. Hierbij worden immunologische, celbiologische, farmacologische en moleculair biologische methoden gebruikt om inzicht te krijgen in ziekteprocessen, wat vervolgens gebruikt wordt voor de ontwikkeling van nieuwe diagnostische of therapeutische toepassingen. Het onderzoek van de EXPIRE groep is ingebed in het Groningen Research Institute for Asthma and COPD (GRIAC) en vindt plaats in nauwe samenwerking met onderzoekers uit klinische en farmacologische afdelingen. Deze vacature betreft een functie binnen een multidisciplinair team van onderzoekers uit de EXPIRE groep en de afdelingen Longziekten en Kinderlongziekten (zie ook gerelateerde informatie rechtsboven).

Binnen het astma remissie project, toegekend door GlaxoSmithKline (GSK) aan het UMCG, zijn we op zoek naar een bio-informaticus op HBO niveau voor een project van in eerste instantie 12 maanden.

De werkzaamheden omvatten analyse van zowel bulk als single-cell RNA seq datasets van luchtwegwand biopten en direct geïsoleerd of gekweekt luchtwegepitheel. Integratie van de verkregen RNA seq data met genotype data, CpG methylatie data en miRNA expressie data behoort ook tot de taken. Daarnaast zal de bio-informaticus bijdragen aan het inrichten van een webomgeving waar de verkregen data toegankelijk worden gemaakt.

Het project wordt uitgevoerd in samenwerking met Sanger/EMBL (Hinxton, Verenigd Koninkrijk), waarbij korte werkstages bij EMBL tot de werkzaamheden kunnen behoren.
Mondelijke en schriftelijke rapportage en deelname aan werkoverleg in een multidiscplinair team van wetenschappers vormen een essentieel onderdeel van de functie.

- Een afgeronde relevante HBO-opleiding.
- Aantoonbare ervaring met de programmeertalen R, Python, Java is een vereiste.
- Bij voorkeur ervaring als bio-informaticus in een translationele onderzoeksgroep op biomedisch terrein.
- Uitgebreide en recente ervaring met RNA seq analyses van weefselmonsters van klinische studies is een vereiste.
- Ervaring met eQTL analyses is een vereiste.
- Ervaring met integratie van meerdere ‘omics’ datasets strekt tot aanbeveling.
- Aantoonbare affiniteit met onderzoek naar chronische longziekten strekt tot aanbeveling.

Het UMCG voert een preventief Hepatitis B beleid. Dit kan betekenen dat u voldoende bescherming tegen Hepatitis B moet hebben opgebouwd voordat u kunt worden aangesteld. Indien nodig verzorgt het UMCG de vaccinatie.

Voor bepaalde beroepsgroepen wordt bij aanstelling een Verklaring Omtrent Gedrag (VOG) gevraagd.

Het betreft een aanstelling voor de duur van minimaal een jaar.
Het salaris bedraagt maximaal € 2.980,- bruto per maand (schaal 7), afhankelijk van opleiding en relevante ervaring, op basis van een fulltime dienstverband. Daarnaast biedt het UMCG 8% vakantietoeslag, 8,3% eindejaarsuitkering en een budget voor ontwikkeling. De arbeidsvoorwaarden zijn conform de CAO Universitair Medische Centra (CAO-UMC).

Neem voor meer informatie contact op met:

dr. Martijn Nawijn, e-mail: m.c.nawijn@umcg.nl (e-mailadres niet gebruiken om te solliciteren)

Extra informatie kan worden verkregen via een van de volgende links:

U kunt uitsluitend reageren via het digitale sollicitatieformulier onderaan deze pagina. Solliciteren kan tot en met 10 juli 2017. Meteen na het verzenden van het digitale sollicitatieformulier wordt een ontvangstbevestiging gemaild met nadere informatie.