Linux system administrator met interesse in genetische big data en HPC in Groningen

Genomics Coordination Center (GCC)

We zoeken een ervaren Linux system administrator voor in het Genomics Coordination Center (GCC): de ‘big data’ research & service hub van het Universitair Medisch Centrum Groningen. Het zijn spannende tijden in de levenswetenschappen met grote biobanken en nieuwe moleculair biologische technieken, die terabytes aan genotype en fenotype profielen opleveren. Dit biedt ongekende mogelijkheden voor het voorspellen van ziekte en gezondheid, maar ook grote uitdagingen in het delen, (her)gebruiken en analyseren van al deze nieuwe, maar vaak gevoelige data. Wij werken daarom met 25 collega’s in diverse lokale, nationale en EU projecten aan slimme software om mensgebonden onderzoek te versnellen en zorg te verbeteren met open source web applicaties (zie http://www.molgenis.org/ ), analyse pipelines en grootschalige e-infrastructuur (HPC clusters, parallel storage systems en cloud). Op deze manier draagt GCC in belangrijke mate bij aan het FAIR (Findable, Accessible, Interoperable, Reusable) maken van research data en wetenschappelijk onderzoek. Hierbij hanteren we een agile aanpak.

Kijk ook onder gerelateerde informatie rechtsboven.

Wij zoeken een ervaren Linux admin of devop voor het functioneel beheer van onze vier HPC rekenclusters (1264 cores) en onze 8 OpenStack ‘cloud’ servers (110 VMs met Apache/Tomcat). Dit behelst o.a. geautomatiseerd configuratie management, monitoring, het maken van verbetervoorstellen/roadmaps, het ontwerpen en inrichten van nieuwe systemen. Bij de uitrol van nieuwe technologieën ben je ook betrokken bij het onderwijs om collega’s in te werken op die technologie. Je ondersteunt een groep primaire gebruikers van de infra die je beheert. Dit zijn aan de ene kant bioinformatici, met als missie grootschalige DNA en RNA data analyse ten behoeve van onderzoek en diagnostiek, en aan de andere kant software engineers, die webapplicaties maken voor analyse van wetenschappelijke en zorgdata. Verder werk je in nauwe samenwerking met sysadmins van het Centrum voor Informatie Technologie (CIT) van de Rijksuniversiteit Groningen alsmede de sysadmins van het UMCG, die al onze IT faciliteiten technisch beheren. Tot slot werk je samen met onze nationale en Europese samenwerkingspartners en heb je veel multidisciplinair contact met toponderzoekers, statistici, diagnostici en artsen.

De ideale kandidaat is professioneel Linux beheerder:
- met aantoonbare ervaring in beheer van VM clouds en/of HPC computer clusters
- is communicatief vaardig, klantvriendelijk en werkt nauwkeurig
- is gewend om te streven naar kwaliteitverbetering; bijvoorbeeld door te werken met versiebeheer, change management, standard operating procedures (SOPs), risico inventarisaties, certificeringstrajecten (ISO/NEN) en bijbehorende audits
- heeft goede mondelinge en schriftelijke uitdrukkingsvaardigheden
- kan zowel zelfstandig als in teamverband werken
- is initiatiefrijk en heeft een proactieve houding
- heeft een goede beheersing van de Nederlandse en Engelse taal in woord en geschrift

We verwachten een HBO of WO achtergrond. Ervaring met wetenschappelijk onderzoek of het werken in een academische omgeving is een pre. Kennis van SLURM, PBS, PostgreSQL, Apache, Elastic, R, python, bash, virtualisatie/cloud technologie, configuratie management tools (ansible, puppet, easybuild, etc), container technologie (Docker), firewalls, continuous delivery, etc, is een pre.

Het UMCG voert een preventief Hepatitis B beleid. Dit kan betekenen dat je voldoende bescherming tegen Hepatitis B moet hebben opgebouwd voordat je kunt worden aangesteld. Indien nodig verzorgt het UMCG de vaccinatie.

Voor bepaalde beroepsgroepen wordt bij aanstelling een Verklaring Omtrent Gedrag (VOG) gevraagd.

Een aanstelling als Linux systeembeheerder in een boeiende omgeving en met ruimte om veel nieuwe kennis op te doen. Het betreft een aanstelling van 0,8 fte, voor een jaar, met een mogelijke verlenging.
Je salaris bedraagt maximaal € 3.816,- bruto per maand (schaal 8 of 9), afhankelijk van kwalificaties en op basis van een fulltime dienstverband. Daarnaast biedt het UMCG 8% vakantietoeslag, 8,3% eindejaarsuitkering en een budget voor ontwikkeling. De arbeidsvoorwaarden zijn conform de CAO Universitair Medische Centra (CAO-UMC).

Meer informatie
Neem voor meer informatie contact op met:
dr. Pieter Neerincx, coördinator e-infrastructuur, dr. Elisa Hoekstra, hoofd analyse team, of prof. dr. Morris Swertz, hoofd Genomics Coordination Center, via telefoon +31 (0)50 361 7100 of e-mail: pieter.neerincx@gmail.com (e-mailadres niet gebruiken om te solliciteren).

Extra informatie kan worden verkregen via een van de volgende links:

Je kunt uitsluitend reageren via het digitale sollicitatieformulier onderaan deze pagina. Solliciteren kan tot en met 23 juli 2017. Meteen na het verzenden van het digitale sollicitatieformulier wordt een ontvangstbevestiging gemaild met nadere informatie.