HPC / cloud Linux sysops/devops met interesse in ‘big data’ DNA en RNA analyses in Groningen

Genetica, Genomics Coordination Center

We zoeken een ervaren Linux system administrator voor in het Genomics Coordination Center (GCC), de ‘big data’ research & service hub van het Universitair Medisch Centrum Groningen, afdeling Genetica. Het zijn spannende tijden met biotechnologie die terabytes aan Biobank, DNA-, gen-, mutatie-, eiwit- moleculaire- en fenotype profielen oplevert. Dit biedt ongekende mogelijkheden voor het voorspellen van ziekte en gezondheid, maar ook grote uitdagingen in het delen, (her)gebruiken en analyseren van al deze nieuwe, maar vaak gevoelige data. Wij werken daarom met 25 collega’s in diverse lokale, nationale en EU projecten aan slimme software om mensgebonden onderzoek te versnellen en zorg te verbeteren met open source web applicaties (zie ), (HPC) analyse pipelines en grootschalige e-infrastructuur (cluster, storage, cloud). Op deze manier draagt GCC in belangrijke mate bij aan het FAIR maken van research data en wetenschappelijk onderzoek. Hierbij hanteren we een agile aanpak.

Wij zoeken een ervaren Linux sysops of devops voor het functioneel beheer van onze vier HPC rekenclusters (30 nodes, 1000+ cpu, 1 petabyte) en onze 8 OpenStack ‘cloud’ servers (100 VMs met onze MOLGENIS software), inclusief geautomatiseerd configuratie management, autorisatie systemen, monitoring, verbetervoorstellen en ontwerpen en inrichten van nieuwe systemen en nieuwe technologieen. Je werkt tussen een team van 6 bioinformatici met als missie geautomatiseerde pipelines voor grootschalige DNA en RNA data analyse ten behoeve van onderzoek en diagnostiek, en 6 software engineers die webapplicaties maken voor analyse van wetenschappelijke en zorgdata. Verder werk je in nauwe samenwerking met het Centrum voor Informatie Technologie (CIT) van de Rijksuniversiteit Groningen die al onze IT faciliteiten technisch beheren en collega systeem beheerders bij UMCG en onze nationale en Europese samenwerkingspartners en heb je veel multidisciplinair contact met toponderzoekers, (bio)statistici, diagnostici en artsen.

De ideale kandidaat is professioneel Linux beheerder:
- met aantoonbare ervaring in cloudomgeving en/of HPC computer clusters
- is communicatief vaardig, klantvriendelijk en werkt nauwkeurig
- heeft goede mondelinge en schriftelijke uitdrukkingsvaardigheden
- kan zowel zelfstandig als in teamverband werken
- is initiatiefrijk en heeft een proactieve houding
- heeft een goede beheersing van de Nederlandse en Engelse taal in woord en geschrift.
We verwachten HBO of WO achtergrond. Ervaring met wetenschappelijk onderzoek of het werken in een academische omgeving is een pre. Kennis van SLURM, PBS, postgresql, R, python, virtualisatie/cloud technologie, microservice infrastructuur, configuratie management tools (ansible, puppet, easybuild, etc), container technologie (Docker), firewalls, continuous delivery, etc, is een pre. Ook achtergrond in Windows wordt gewaardeerd voor kleine hulp in onze ziekenhuisomgeving.

Het UMCG voert een preventief Hepatitis B beleid. Dit kan betekenen dat u voldoende bescherming tegen Hepatitis B moet hebben opgebouwd voordat u kunt worden aangesteld. Indien nodig verzorgt het UMCG de vaccinatie.

Een aanstelling voor 0.8 fte als Linux systeembeheerder in een boeiende omgeving en met ruimte om veel nieuwe kennis op te doen, voor één jaar, met een mogelijke verlenging.
Uw salaris bedraagt minimaal € 2.178,- tot maximaal € 3.339,- bruto per maand (schaal 7 of 8) afhankelijk van kwalificaties en op basis van een fulltime aanstelling. Daarnaast biedt het UMCG 8% vakantietoeslag, 8,3% eindejaarsuitkering en een budget voor ontwikkeling. Arbeidsvoorwaarden conform de CAO Universitair Medische Centra (CAO-UMC).

Meer informatie
Neem voor meer informatie contact op met:
dr. Pieter Neerincx, coördinator e-infrastructuur, of dr. Elisa Hoekstra, hoofd analyse team, of prof.dr. Morris Swertz, hoofd Genomics Coordination Center, via telefoon +31 (0) 50 361 7100 of e-mail: pieter.neerincx@gmail.com (e-mailadres niet gebruiken voor sollicitaties).

Extra informatie kan worden verkregen via een van de volgende links:

U kunt uitsluitend reageren via het digitale sollicitatieformulier onderaan deze pagina. Solliciteren kan tot en met 11 april 2017. Meteen na het verzenden van het digitale sollicitatieformulier wordt een ontvangstbevestiging gemaild met nadere informatie.